La flora característica de la entidad son la palma, maguey, los bosques de pino y encino, los manglares y pastizales. Las especies que se encuentran en Totonacapan incluyen el cedro, caoba, higuera, chaca, zapote, mamey, nanche, guácima y pimienta.

También coexisten el ojite, chicozapote, orejón, uvero, ceiba, jobo, anona, coyol, espino  y nopal.

Los principales productos de la agricultura son: maíz, caña de azúcar, café, fríjol, chile, papa, vainilla, tabaco, cacao, ajonjolí, tomate y frutas (naranja, piña y limón).